L'histoire comparative des pratiques de simulation sur ordinateur des systèmes vivants montre qu'à partir des années 1990, à côté des usages traditionnels de la simulation numérique, se sont fortement développées des pratiques de simulation intégrative et spatiale, intégrant prioritairement les 3 dimensions de l'espace dans une dynamique temporelle complexe et multiprocessus. Les processus de croissance et de morphogenèse ont en particulier été de plus en plus été représentés de manière quasi-iconique par ces simulations à base de multi-modèles. Dans cet exposé, Franck Varenne montrera que l'iconicité n'est pas tant recherchée pour elle-même. Bien plutôt, une telle représentation discrétisée en 3D (ou 4D, i.e. 3D + temps) présente l'intérêt fondamental de permettre l'intégration at runtime, c'est-à-dire au cours de la croissance calculée, d'une grande quantité de processus formellement et axiomatiquement hétérogènes, tant mécaniques, que chimiques, physiologiques et biologiques.